หัวข้อของการบำบัดน้ำเสียจุลินทรีย์ดับกลิ่นครอบคลุมสองประเภทหลัก ๆ คือการบำบัดทางอุตสาหกรรมและในประเทศน้ำที่จำเป็นต้องบำบัดจากแหล่งภายในประเทศต้องผ่านขั้นตอนสองขั้นตอนในกระบวนการขจัดสิ่งปนเปื้อน ขั้นตอนที่สามที่เรียกว่าการรักษาระดับตติยภูมิอาจตามมาด้วยการฆ่าเชื้อจุลินทรีย์ดับกลิ่นมีหลายกระบวนการที่เกี่ยวข้อง แต่นี่เป็นขั้นตอนหลักในการบำบัดน้ำน้ำที่ปนเปื้อนในระดับที่จำเป็นต้องบำบัดอย่างมีนัยสำคัญนั้นมาจากสองแหล่งหลัก

จุลินทรีย์ดับกลิ่นน้ำที่มาจากสถานประกอบการค้า

หรืออุตสาหกรรมอยู่ภายใต้หัวข้อของเสียอุตสาหกรรมจุลินทรีย์ดับกลิ่นแหล่งน้ำหลักอื่นๆ ที่ปนเปื้อนมาจากแหล่งในประเทศและรวมถึงน้ำที่ไหลบ่าหรือน้ำผิวดินที่มากเกินไปและน้ำเสียหรือน้ำที่ปนเปื้อนจากการใช้ในบ้านเรือน ทั้งสองอยู่ภายใต้หัวข้อทั่วไปของการบำบัดน้ำเสียสิ่งปฏิกูลคือของเสียที่บรรทุกในน้ำจากแหล่งในประเทศจุลินทรีย์ดับกลิ่นเช่น จากการซักและซักผ้าจากอ่างในครัวที่เกี่ยวข้องกับการเตรียมอาหารปัสสาวะและอุจจาระ

• ทุกประเภทเหล่านี้ประกอบด้วยสิ่งมีชีวิตที่ติดเชื้อ รวมทั้งแบคทีเรีย ไวรัส สปอร์ และโปรตีนที่ก่อให้เกิดโรคที่เรียกว่าพรีออนสิ่งปฏิกูลต้องได้รับการบําบัดก่อนปล่อยสู่สิ่งแวดล้อม
• เนื่องจากอาจก่อให้เกิดโรคจุลินทรีย์ดับกลิ่นการปนเปื้อนของแม่น้ำ ทะเลสาบ หรือน้ำบาดาล หรือเป็นอันตรายต่อพืชและสัตว์เนื่องจากความเป็นพิษจุลินทรีย์ดับกลิ่น

ขั้นตอนแรกในการบำบัดน้ำเสียเรียกว่าขั้นตอนหลัก ส่วนใหญ่ประกอบด้วยการปล่อยน้ำลงในถังในช่วงเวลาที่ขยะมูลฝอยอาจจมลงสู่ก้นบ่อและกากตะกอนที่เป็นผลจะถูกขูดหรือสูบออกไปยังโรงงานแยกต่างหากเพื่อบำบัด น้ำมันและจาระบีสามารถลอยขึ้นสู่พื้นผิวพร้อมๆ กันได้ ซึ่งกำจัดออกโดยใช้กระบวนการต่างๆ ขั้นตอนหลักเรียกว่าการตกตะกอนขั้นต่อไปคือระยะที่สอง ซึ่งตะกอนจะถูกบำบัดโดยการเติมอากาศให้ผสมกับออกซิเจน

จุลินทรีย์ดับกลิ่นซึ่งจำเป็นสำหรับกระบวนการทางชีววิทยา

จุลินทรีย์ดับกลิ่นที่เกี่ยวข้องกับแบคทีเรียในการย่อยสลายสารปนเปื้อนและจับซากที่เหลือให้เป็นของแข็งได้ สิ่งอำนวยความสะดวกรองเหล่านี้จัดอยู่ในประเภทฟิล์มติดแน่นหรือระบบการเจริญเติบโตแบบแขวนลอย ประเภทฟิล์มคงที่ใช้การผสมผสานของการกรองและการรวบรวมของแข็งบนสื่อการเจริญเติบโตจุลินทรีย์ดับกลิ่นวิธีการเจริญเติบโตที่ถูกระงับจะผสมจุลินทรีย์กับกากตะกอน ดังนั้น กระบวนการสร้างของเสียให้เป็นของแข็งสามารถเกิดขึ้นได้ขั้นตติยภูมิคือการพัฒนาคุณภาพน้ำต่อไป ซึ่งทำได้โดยใช้เทคนิคต่างๆ ร่วมกันเช่นจุลินทรีย์ดับกลิ่น

จุลินทรีย์ดับกลิ่นการกรองทรายเพื่อขจัดสิ่งปนเปื้อนที่เหลือและการตกตะกอน ลากูนเป็นบ่อกักเก็บซึ่งมีจุดประสงค์เพื่อให้เกิดการตกตะกอนในขั้นสุดท้ายขั้นตอนสุดท้ายคือการฆ่าเชื้อโดยเติมสารลงในน้ำเพื่อทำลายจุลินทรีย์ที่เหลือ โดยใช้วิธีการต่างๆ เช่น โอโซน คลอรีน หรือแสงอัลตราไวโอเลตจุลินทรีย์ดับกลิ่น ราคาน้ำจะถูกฆ่าเชื้อเพียงพอที่จะปล่อยสู่สิ่งแวดล้อม คลอรีนเป็นคลอรีนที่พบมากที่สุดแต่อาจเป็นอันตรายต่อสุขภาพรังสีอัลตราไวโอเลตมีประสิทธิภาพมากในการฆ่าเชื้อแบคทีเรีย แต่บางชนิดอาจยังคงอยู่เนื่องจากของแข็งในน้ำ โอโซนเป็นวิธีที่ปลอดภัยที่สุด แต่แพงที่สุด